| Крылов А.А. | (директор с 1896 по 1899) |
| Владимирский С.А. | (директор с 1899 по 1902) |
| Докторов А.П. | (директор с 1902 по 1911) |
| Зограф К.Ю. | (директор с 1911 по 1921) |
| Пантелеев В.П. | (директор в 1921) |
| Иванов А.К. | (директор с 1921 по 1922) |
| Тищенко И.А. | (директор с 1922 по 1929) |
| Гурвич М.Н. | (директор с 1929 по 1930) |
| Тихменев Н.С. | (директор с 1930 по 1933) |
| Орлов И.П. | (директор с 1933 по 1936) |
| Маслов А.М. | (директор с 1936 по 1937) |
| Пильский И.Я. | (директор с 1937 по 1943) |
| Дыбина П.В. | (директор с 1942 по 1948) |
| Жаворонков Н.М. | (директор, ректор с 1948 по 1962) |
| Кафтанов С.В. | (ректор с 1962 по 1972) |
| Ягодин Г.А. | (ректор с 1973 по 1985) |
| Саркисов П.Д. | (ректор с 1985 по 2006 ) |
| Колесников В.А. | (ректор с 2006) |